Hakodate, région d'Hokkaido, dans le nord du Japon. Une carte de Kaito Kid est retrouvée par hasard dans les entrepôts du groupe Onoe. Parallèlement à cette étrange trouvaille, un cadavre tailladé d'une mystérieuse croix à la poitrine est découvert dans le quartier des entrepôts de Hakodate. De minutieuses investigations mènent rapidement les enquêteurs vers le "vendeur de mort", un Américain d'origine japonaise connu pour être un membre important d'un fort lucratif trafic d'armes qui se tient dans le bassin asiatique. Place à une chasse au trésor épique pour le détective Conan et pour ses fidèles acolytes appelés à la rescousse...